Η σημαντικότερη αλλαγή αφορά το νέο ευρωπαϊκό σύστημα εισόδου και εξόδου (Entry/Exit System – EES), το οποίο έχει τεθεί σε πλήρη λειτουργία και αντικαθιστά σταδιακά τις παραδοσιακές σφραγίδες στα διαβατήρια με ψηφιακή καταγραφή στοιχείων και βιομετρικών δεδομένων. Οι ταξιδιώτες από χώρες εκτός Ευρωπαϊκής Ένωσης θα καταγράφονται ηλεκτρονικά μέσω φωτογραφίας και δακτυλικών αποτυπωμάτων κατά την είσοδο και έξοδο από τη Ζώνη Σένγκεν.

Στόχος του νέου συστήματος είναι η ενίσχυση της ασφάλειας και η καλύτερη διαχείριση των συνόρων, ωστόσο η εφαρμογή του έχει ήδη προκαλέσει προβληματισμό στον ταξιδιωτικό κλάδο. Σε αρκετά ευρωπαϊκά αεροδρόμια έχουν καταγραφεί μεγάλες ουρές και καθυστερήσεις, ιδιαίτερα σε περιόδους αυξημένης κίνησης, με τις αεροπορικές εταιρείες και τους φορείς του τουρισμού να ζητούν μεγαλύτερη ευελιξία κατά τη μεταβατική περίοδο.